Aqui temos um exemplo de projeto utilizando Classes e Arraylist. No próximo artigo temos uma sequência de vídeos exemplicando o funcionamento do código.

classe Pessoa.java

public class Pessoa {
    public static int contador;
    private int id;
    private String nome;
    private String telefone;
    private String email;

    //construtor da classe pessoa
    public Pessoa(String nome, String telefone, String email) {
        contador++;
        this.id = contador;
        setNome(nome);
        setTelefone(telefone);
        setEmail(email);
    }

    public int getId() {
        return id;
    }

    public void setNome(String nome) {
        //aqui implementariamos as validações necessárias
        //antes de inserir o nome  
        this.nome = nome;
    }

    public String getNome() {
        return nome;
    }

    public void setTelefone(String telefone) {
        //aqui implementariamos as validações necessárias
        //antes de inserir o telefone 
        this.telefone = telefone;
    }

    public String getTelefone() {
        return telefone;
    }

    public void setEmail(String email) {
        //aqui implementariamos as validações necessárias
        //antes de inserir o email 
        this.email = email;
    }

    public String getEmail() {
        return email;
    }

    //cria o método toString para sobrescrever através do @overrride "annotations" utilizado
    // para converter o objeto para string
    //quando for necessário imprimir os dados do objeto na tela por outra parte do nosso
    //programa. 
    @Override
    public String toString() {
        return "ID: " + id + ", Nome: " + nome + ", Telefone: " + telefone + ", Email: " + email;
    }
}

Classe App.java

import java.util.ArrayList;
import java.io.IOException;
import java.util.Scanner;

public class App {
    //Aqui definimos a lista contatos e teclado como variaveis globais
    //pois já estamos utilizando a orientação a objetos para ter uma melhor
    //separação não sendo necessário termos tanta proteção às variaveis do
    //programa principal
    private static ArrayList<Pessoa> listaContatos = new ArrayList<Pessoa>();
    private static Scanner teclado = new Scanner(System.in);

    public static void main(String[] args) {
        //guarda a opcao selecionada pelo usuario no menu
        int opcao;

        do {
            limparTela();
            //obtem a opcao desejada pelo usuario
            opcao = obterEscolhaMenu();

            //executa a funcionalidade conforme escolhido pelo usuario
            processarEscolhaMenu(opcao);
        } while (opcao != 5);
    }

    private static void processarEscolhaMenu(int opcao){
        switch (opcao) {
            case 1:
                incluirContato();
                pausa();
                break;
            case 2:
                alterarContato();
                break;
            case 3:
                consultarContatos();
                break;
            case 4:
                excluirContato();
                pausa();
                break;
            case 5:
                System.out.println("Saindo do sistema...");
                break;
            default:
                System.out.println("Opção inválida. Tente novamente.");
        }
    }

    private static int obterEscolhaMenu(){
        int opcao;

        System.out.println("\n--- Menu de Gerenciamento de Contatos ---\n");

        System.out.println("1. Incluir Contato");
        System.out.println("2. Alterar Contato");
        System.out.println("3. Consultar Contatos");
        System.out.println("4. Excluir Contato");
        System.out.println("5. Sair");

        System.out.print("\nEscolha uma opção: ");
        opcao = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine(); // Limpeza buffer

        return opcao;
    }

    private static void incluirContato() {
        System.out.print("Digite o nome: ");
        String nome = teclado.nextLine();

        System.out.print("Digite o telefone: ");
        String telefone = teclado.nextLine();

        System.out.print("Digite o email: ");
        String email = teclado.nextLine();

        Pessoa novaPessoa = new Pessoa(nome, telefone, email);
        listaContatos.add(novaPessoa);
        System.out.println("Contato incluído com sucesso!");
    }

    private static void alterarContato() {
        System.out.print("Digite o ID do contato a ser alterado: ");
        int id = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine(); // limpeza buffer

        limparTela();

        //busca a pessoa especificada pelo id
        Pessoa pessoa = encontrarContatoPorId(id);

        if (pessoa != null) {

            System.out.print("Digite o novo nome (ou deixe em branco para manter): ");
            String nome = teclado.nextLine();
            //metodo isBlank retorna true se a string estiver vazia
            //é equivalente a fazer nome.equals("");
            if (!nome.isBlank())
                pessoa.setNome(nome);

            System.out.print("Digite o novo telefone (ou deixe em branco para manter): ");
            String telefone = teclado.nextLine();
            if (!telefone.isBlank())
                pessoa.setTelefone(telefone);

            System.out.print("Digite o novo email (ou deixe em branco para manter): ");
            String email = teclado.nextLine();
            if (!email.isBlank())
                pessoa.setEmail(email);

            System.out.println("Contato alterado com sucesso!");
        } else {
            System.out.println("Contato não encontrado.");
            pausa();
        }
    }

    private static void consultarContatos() {
        //metodo isEmpty verifica se a lista esta vazia
        if (listaContatos.isEmpty()) {
            System.out.println("Nenhum contato cadastrado.");
        } else {
            System.out.println("\n--- Lista de Contatos ---");
            for (Pessoa pessoa : listaContatos) {
                System.out.println(pessoa);
            }
        }
        pausa();
    }

    private static void excluirContato() {
        //obtem o id do contato;
        System.out.print("Digite o ID do contato a ser excluído: ");
        int id = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine(); // Consumir quebra de linha

        //encontra o contato
        Pessoa pessoa = encontrarContatoPorId(id);
        
        //excluir o contato
        if (pessoa != null) {
            listaContatos.remove(pessoa);
            System.out.println("Contato excluído com sucesso!");
        } else {
            System.out.println("Contato não encontrado.");
        }
    }

    private static Pessoa encontrarContatoPorId(int id) {
        //varre o array list para encontrar o id pesquisado
        for (Pessoa pessoa : listaContatos) {
            if (pessoa.getId() == id) {
                //encontrou retorna o objeto pessoa
                return pessoa;
            }
        }
        //se chegou até aqui não existe este id
        return null;
    }


    private static void limparTela(){
        try {
            if (System.getProperty("os.name").contains("Windows"))
                new ProcessBuilder("cmd", "/c", "cls").inheritIO().start().waitFor();
            else
                new ProcessBuilder("clear").inheritIO().start().waitFor();

        } catch (IOException | InterruptedException ex) {}
    }

    private static void pausa(){
        System.out.println("\nTecle ENTER para continuar.");
        teclado.nextLine();
    }

}

A seguir temos um versão modificada da classe App.java, utilizando o conceito de ENUM para melhorar o código no que se refere ao uso de "códigos mágicos" para processar os itens do menu.

import java.util.ArrayList;
import java.io.IOException;
import java.util.Scanner;

public class App {

    // ===== ENUM EMBUTIDO =====
    private enum MenuOpcao {

        INCLUIR(1, "Incluir Contato"),
        ALTERAR(2, "Alterar Contato"),
        CONSULTAR(3, "Consultar Contatos"),
        EXCLUIR(4, "Excluir Contato"),
        SAIR(5, "Sair");

        private final int codigo;
        private final String descricao;

        MenuOpcao(int codigo, String descricao) {
            this.codigo = codigo;
            this.descricao = descricao;
        }

        public int getCodigo() {
            return codigo;
        }

        public String getDescricao() {
            return descricao;
        }

        public static MenuOpcao fromCodigo(int codigo) {
            for (MenuOpcao opcao : values()) {
                if (opcao.codigo == codigo) {
                    return opcao;
                }
            }
            return null;
        }
    }

    // ===== VARIÁVEIS GLOBAIS =====
    private static ArrayList listaContatos = new ArrayList<>();
    private static Scanner teclado = new Scanner(System.in);

    public static void main(String[] args) {

        MenuOpcao opcao;

        do {
            limparTela();
            opcao = obterEscolhaMenu();
            processarEscolhaMenu(opcao);
        } while (opcao != MenuOpcao.SAIR);
    }

    private static void processarEscolhaMenu(MenuOpcao opcao) {

        if (opcao == null) {
            System.out.println("Opção inválida. Tente novamente.");
            pausa();
            return;
        }

        switch (opcao) {
            case INCLUIR:
                incluirContato();
                pausa();
                break;

            case ALTERAR:
                alterarContato();
                break;

            case CONSULTAR:
                consultarContatos();
                break;

            case EXCLUIR:
                excluirContato();
                pausa();
                break;

            case SAIR:
                System.out.println("Saindo do sistema...");
                break;
        }
    }

    private static MenuOpcao obterEscolhaMenu() {

        System.out.println("\n--- Menu de Gerenciamento de Contatos ---\n");

        for (MenuOpcao opcao : MenuOpcao.values()) {
            System.out.println(opcao.getCodigo() + ". " + opcao.getDescricao());
        }

        System.out.print("\nEscolha uma opção: ");
        int codigo = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine(); // limpar buffer

        return MenuOpcao.fromCodigo(codigo);
    }

    // ===== FUNCIONALIDADES =====

    private static void incluirContato() {
        System.out.print("Digite o nome: ");
        String nome = teclado.nextLine();

        System.out.print("Digite o telefone: ");
        String telefone = teclado.nextLine();

        System.out.print("Digite o email: ");
        String email = teclado.nextLine();

        Pessoa novaPessoa = new Pessoa(nome, telefone, email);
        listaContatos.add(novaPessoa);

        System.out.println("Contato incluído com sucesso!");
    }

    private static void alterarContato() {
        System.out.print("Digite o ID do contato a ser alterado: ");
        int id = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine();

        limparTela();

        Pessoa pessoa = encontrarContatoPorId(id);

        if (pessoa != null) {
            System.out.print("Digite o novo nome (ou deixe em branco): ");
            String nome = teclado.nextLine();
            if (!nome.isBlank()) pessoa.setNome(nome);

            System.out.print("Digite o novo telefone (ou deixe em branco): ");
            String telefone = teclado.nextLine();
            if (!telefone.isBlank()) pessoa.setTelefone(telefone);

            System.out.print("Digite o novo email (ou deixe em branco): ");
            String email = teclado.nextLine();
            if (!email.isBlank()) pessoa.setEmail(email);

            System.out.println("Contato alterado com sucesso!");
        } else {
            System.out.println("Contato não encontrado.");
            pausa();
        }
    }

    private static void consultarContatos() {
        if (listaContatos.isEmpty()) {
            System.out.println("Nenhum contato cadastrado.");
        } else {
            System.out.println("\n--- Lista de Contatos ---");
            for (Pessoa pessoa : listaContatos) {
                System.out.println(pessoa);
            }
        }
        pausa();
    }

    private static void excluirContato() {
        System.out.print("Digite o ID do contato a ser excluído: ");
        int id = teclado.nextInt();
        teclado.nextLine();

        Pessoa pessoa = encontrarContatoPorId(id);

        if (pessoa != null) {
            listaContatos.remove(pessoa);
            System.out.println("Contato excluído com sucesso!");
        } else {
            System.out.println("Contato não encontrado.");
        }
    }

    private static Pessoa encontrarContatoPorId(int id) {
        for (Pessoa pessoa : listaContatos) {
            if (pessoa.getId() == id) {
                return pessoa;
            }
        }
        return null;
    }

    private static void limparTela() {
        try {
            if (System.getProperty("os.name").contains("Windows"))
                new ProcessBuilder("cmd", "/c", "cls").inheritIO().start().waitFor();
            else
                new ProcessBuilder("clear").inheritIO().start().waitFor();
        } catch (IOException | InterruptedException e) {}
    }

    private static void pausa() {
        System.out.println("\nTecle ENTER para continuar.");
        teclado.nextLine();
    }
}